環境分析是離子色譜儀較重要的應用領域之一：可分為水，土壤和空氣分析，離子色譜在環境分析化學中應用的主要焦點是水中各種陰陽離子的定性和定量分析，離子色譜法還可用于分析天然鹵水中的離子，包括海水，地下鹵水，地熱鹵水和高鹽度地下水。

　　由于其大規模的工業用途和極強的毒性，環境中各種樣品中氰化物的測定非常重要，在迄今為止為氰化物和硫化物開發的所有分析方法儀器維修中，必要的步是去除干擾物，使用離子色譜法，氰化物和硫化物可以同時分離和測量，多磷酸鹽因其螯合和分散特性而廣泛用于工業水處理應用。

　　價鉻是一種有毒形式的鉻，必須在制造廢物中對其進行監測，在柱后添加二苯卡巴肼的離子色譜法可能是可用于測定六價鉻的較具體和較靈敏的方法之一，通過消毒過程進行水處理被認為是20世紀一項重大的公共衛生成就，因此，水污染物的鑒儀器儀表維修別方法已經從微生物轉向化學。

　　飲用水中鑒定出的化學物質數量呈指數增長，然而，在數百人中，很少有人研究或記錄了它們對健康影響的證據，近十年來，利用臭氧處理飲用水以改善口感和氣味，去除有機和無機微污染物越來越受歡迎，在80年代初期，人們清楚地認識到臭氧在飲用水處理中的應用不僅會導致含氧化合物的形成，還會導致溴化物的形成，還形成溴化有機化合物和溴酸鹽儀器送檢。

　　從氣質聯用儀的構造上來說，氣質聯用儀可以看做是質量檢測器與毛細管柱氣相色譜儀的結合體，所以氣質聯用儀出現的問題也主要是這二者相加，而在我們操作的過程中，接觸較多的基本上是換柱和清洗離子源，這就導致部分問題的出現，其主要表現是漏氣，從而造成抽真空不正常，這一問題的產生主要是毛細管柱進入質譜腔的接口與質譜腔體開門時的密封圈嚙合不正常，之間存在的間隙使得這兩者的密封程度不夠。

　　對于這一問題，的技術人員認為，處理的時候需要注意，伸入腔中的長度需要適當，太短或者太長都不適合，同時墊圈的松緊要合適，太緊容易壓碎墊圈，而太松的話，就會存在漏氣的隱患，這個問題在平常的操作過程中是可以避免的，需要操作人員能夠了解部分氣質聯用儀的維修與保養的知識，這樣的話，一旦出現問題也可以自己去查找原因并尋找到處理方式，儀器校準。